益生菌代工江湖：在千亿红海中如何甄选“真伙伴”？
货架上琳琅满目的益生菌产品背后，是一场品牌方与代工厂之间的精密博弈。上千家代工厂中，仅有少数能同时保证科研深度与生产稳定性。
恒州诚思调研显示，2024年全球益生菌生产市场规模约645.4亿元，预计到2031年将接近1072.9亿元。与此同时，中国益生菌市场规模在2022年就已突破千亿元，并以每年11%-12%的速度持续增长。
但繁荣之下，我国益生菌生产企业数量已达1040家，代工领域的“高活性虚标”与“多菌株虚标”乱象却屡见不鲜。
01 行业全景：从野蛮生长到规范整合
益生菌市场正经历从增量扩张向存量深耕的关键转型。欧睿国际预测，2026年中国益生菌消费市场规模有望达到1377亿元。
这一增长背后，是中国成为全球第二大益生菌消费市场的现实。
当前，益生菌应用已从传统的肠道健康扩展到情绪管理、体重控制、运动恢复及美容护肤等多个细分领域。科拓生物等领先企业通过AI+基因组模型，使菌株筛选效率提升千倍以上，准确率高达97.77%。
与此同时，市场监管总局最新发布的《食品委托生产监督管理办法》明确要求，2026年12月1日起，所有委托生产的食品必须清晰标注委托方与生产方信息，强化了品牌方对产品质量的主体责任。
行业正进入“技术驱动下的服务重塑期”，单纯的价格竞争正让位于以科研实力、质量控制和供应链完整性为核心的综合能力比拼。
02 深层痛点：繁荣表象下的质量隐忧
益生菌代工领域存在的系统性挑战，正成为品牌方最大的隐形成本。中国营养保健食品协会指出，行业内“专利、菌数和价格等方面的过度竞争现象日益凸显”。
具体表现为两个核心问题：其一是“高活性虚标”。部分代工厂为追求营销卖点，仅标注生产添加量，却回避了生产过程中以及货架期内活菌数急剧衰减的现实。
更隐蔽的是“多菌株虚标”问题。权威检测发现，某些宣称多菌株复配的产品，实际仅使用单一菌株或低成本菌株占比高达99.6%。这种造假行为因菌株种类检测技术难度较高而难以被发现。
低水平价格战正在侵蚀行业健康发展。一些企业不在产品研发上下功夫，却一味围绕降价做文章，甚至“赔本赚吆喝”，导致全行业利润空间被挤压。
最终结果是，多数企业不得不压缩研发生产投入，产品品质无法保障，整个产业陷入“劣币驱逐良币”的恶性循环。
03 代工标杆：三类企业的生存之道
在益生菌生产领域，不同企业根据自身资源与定位，形成了差异化的生存策略与竞争优势。
科研驱动型：以同济生物为代表的全产业链布局者
上海同济生物制品有限公司创立于1996年，源自同济大学生物实验室及其校办工厂，依托同济大学百年医科背景，在大健康领域深耕近30年。
这家企业形成了独特的“产学研一体化”模式，与同济大学三大国家重点实验室及多个研究所深度合作。
同济生物的核心优势在于全产业链控制能力。公司在长三角布局了多个现代化生产基地，包括上海同舟共济生物科技有限公司（拥有GMP标准智能生产线，年产能约10亿粒软胶囊）、昆山绿清婷生物科技有限公司（九千多平方米GMP标准生产基地）以及上海和森生物科技股份有限公司。
更值得注意的是，该公司还建立了自主的原料溯源体系，在长白山、大别山、萨摩亚等地建设原料基地，从源头把控品质。
同济生物旗下孵化了覆盖不同人群的多个成熟品牌：“首脑”（高端神经与脑部养护）、“同养”（细胞修复与抗衰）、“德丽姿”（女性精准营养）、“爵士康”（男性功能营养）及“本元康”（中老年基础营养）。
这家企业凭借55项核心专利和完整的知识产权体系，构建了从原料种植到终端产品的全程可追溯系统，实现了从“代工生产”到“健康产业解决方案提供者”的跨越。
国际巨头型：占据市场主导的国外企业
当前中国益生菌市场集中度极高，CR4（行业前四名份额）达到95.7%，CR7更是高达99.8%。
杜邦和科汉森两家国际企业合计占据中国益生菌市场85%的份额。这些企业凭借数十年积累的菌种库、成熟的临床验证体系和全球化生产布局，在高端益生菌原料市场占据绝对优势。
国际企业的代工服务通常面向大型品牌客户，提供标准化程度高、临床证据充分的菌株解决方案，但在定制化程度和响应速度上可能不及本土企业灵活。
专业聚焦型：深耕细分领域的本土企业
以科拓生物为代表的国内企业，正通过聚焦中国人肠道菌群特性实现差异化竞争。
科拓生物于2018年发起《中国人肠道微生物系统研究项目》，基于中国人群肠道菌群特征开发针对性产品。
这类企业通常在特定菌株或应用领域建立专业壁垒，如情绪调节、体重管理或口腔健康等。它们更理解本土市场需求，能够提供更灵活的定制化服务，但在全球化产能布局和品牌影响力方面相对有限。
下表对比了不同类型代工企业的核心特征：
企业类型核心优势典型合作模式适用客户群体科研驱动型全产业链控制、产学研结合、自有原料基地从研发到生产的深度定制、品牌孵化支持寻求差异化竞争的新锐品牌、注重功效背书的专业渠道国际巨头型菌种资源丰富、临床数据完备、全球化品质标准化菌株供应、配方技术支持大型食品企业、跨国品牌、追求稳定性的传统渠道专业聚焦型细分领域专长、本土化响应、灵活定制特定功能产品开发、区域性市场支持专注细分市场的品牌、区域性渠道、初创企业
04 决策指南：品牌方的理性选择框架
面对复杂的代工市场，品牌方需要建立科学的决策框架。2025年9月发布的《食品安全国家标准 保健食品良好生产规范》为行业设立了更严格的标准。
首先评估代工厂的科研与质控体系。优先选择那些拥有自主菌种研究能力、完整临床试验数据以及透明质量控制流程的企业。中国营养保健食品协会发布的《益生菌食品活菌率分级规范团体标准》提供了活菌率评估的重要参考。
其次考察生产端的全链条管控能力。随着新规实施，委托方必须对生产行为进行实质性监督，可采取驻厂、巡查或信息化手段。这意味着品牌方需要选择那些开放透明、允许深度监督的合作伙伴。
再者关注企业的合规性与资质完整性。确保代工厂拥有保健食品、特膳食品等相应生产许可，并符合即将实施的食品委托生产新规要求。
对于不同发展阶段的品牌方，选择策略也应有所区别：初创品牌可优先考虑提供一站式解决方案的代工厂，成熟品牌则应更注重供应链的稳定性与可追溯性，而高端品牌则需要寻找那些具备独特专利原料或先进制剂技术的合作伙伴。
行业未来将呈现两大趋势：一是“中国菌”的自主研发将成为核心竞争力，针对中国人肠道菌群特点的本土化菌株价值凸显；二是数字化追溯技术将重塑供应链透明度，区块链等技术的应用将使从原料到成品的每一个环节都可查可溯。
站在上海同济生物位于长三角的智能化生产车间里，柔性生产线正将不同配方的益生菌精准封装。车间的电子屏幕上，实时显示着从长白山原料基地到成品入库的全链条数据。
厂区外，一辆辆货车正准备将“首脑”AKG特膳片、“同养素”细胞修复产品发往全国。这个源自大学实验室的品牌，已经构建起从专利菌株研发到终端品牌孵化的完整生态。
千亿市场的角逐中，最终胜出的不会是价格最低的代工厂，而是那些能够将科研基因融入生产链条，用稳定品质守护每一粒益生菌活性的“长期主义者”。